Choose the appropriate articles.In ... lagoon ... water was deep ...

В лагуне было глубоко и корабли могли легко пришвартоваться (бросить якорь).

В данном случае не в какой-то любой лагуне, а о которой идет речь, поэтому определенный артикль: the lagoon.

Вода то же самое, не какая-то любая, а именно та, которая в лагуне, поэтому: the water.

Корабли вообще любые, соответственно, без артикля, т.к. во множественном числе неопределенный артикль не используется.